More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0563 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.51 
 
 
460 aa  655    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00434596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
477 aa  944    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00974378  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
324 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.399045  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
326 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
325 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
326 aa  153  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  30.24 
 
 
324 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
325 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.2 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
334 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2469  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.21 
 
 
345 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 
326 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.63 
 
 
333 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2322  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  27.27 
 
 
348 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.46 
 
 
331 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
325 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
321 aa  144  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 
328 aa  143  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2083  ABC transporter, permease  27.42 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
329 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
340 aa  139  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
349 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  hitchhiker  0.0000268959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.25 
 
 
328 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  28.91 
 
 
328 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
349 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7447  ABC transporter, permease  26.3 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
341 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0238996  normal  0.501572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
326 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 
355 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000755906  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.68 
 
 
338 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.5 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  28.12 
 
 
321 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
398 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00903632  normal  0.254624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
339 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7457  peptide ABC transporter, permease protein  28.71 
 
 
334 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  27.86 
 
 
321 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
361 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  26.75 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.94 
 
 
340 aa  131  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
347 aa  131  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  28.83 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000400167 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
321 aa  130  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3753  Alkaline phosphatase  28.57 
 
 
336 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.634321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  28.31 
 
 
336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04910  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06400  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.38 
 
 
326 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36653  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.04 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
338 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  27.53 
 
 
351 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
315 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
335 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0893  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 
338 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
321 aa  126  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
319 aa  126  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
321 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.52 
 
 
321 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  27.01 
 
 
339 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  27.53 
 
 
336 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
321 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  27.01 
 
 
339 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  27.01 
 
 
339 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
345 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
321 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  28.53 
 
 
339 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1527  nickel-transporting ATPase  26.33 
 
 
338 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
328 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000643204  unclonable  0.00000000002362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21750  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.17 
 
 
362 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211245  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
321 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 
313 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 
332 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00733957  hitchhiker  0.00049009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
334 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
325 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.480445  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 
336 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.01 
 
 
336 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  26.82 
 
 
339 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  28.28 
 
 
339 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.85 
 
 
318 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  27.27 
 
 
336 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.47 
 
 
327 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
336 aa  123  6e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
334 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  27.01 
 
 
336 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 
334 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057278  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  42.18 
 
 
321 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.94 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.89 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.74241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>