More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1169 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.51 
 
 
477 aa  655    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00974378  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
460 aa  920    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00434596  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
478 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
321 aa  179  9e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
321 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.8818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
355 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0791674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
321 aa  163  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
334 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
321 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0231928  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
321 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 
326 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 
321 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0148  peptide ABC transporter, permease protein  30.91 
 
 
328 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
329 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 
321 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002585  (GlcNAc)2 ABC transporter permease component 1  29.61 
 
 
328 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
321 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
324 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
329 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2577  ABC-type [(GlcNAc)2] transporter, permease protein  29.58 
 
 
328 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.46 
 
 
333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
321 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000859188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  31.17 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  28.05 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.68 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.01 
 
 
336 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
325 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  28.01 
 
 
336 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.15 
 
 
332 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36520  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.09 
 
 
341 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445478  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.6 
 
 
361 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  27.94 
 
 
351 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
328 aa  143  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.94 
 
 
340 aa  143  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.449597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.95 
 
 
326 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  28.8 
 
 
323 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
336 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2554  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  26.96 
 
 
336 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1650  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.2 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  29.5 
 
 
336 aa  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2257  oligopeptide ABC transporter, permease component  29.06 
 
 
321 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
336 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
336 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.88 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
332 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.27 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.115178  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.61 
 
 
341 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0238996  normal  0.501572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
339 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0777268  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  27.15 
 
 
337 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2593  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0004  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.53 
 
 
320 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.101832  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.35 
 
 
325 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
355 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.83 
 
 
345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.16813  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  26.18 
 
 
336 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  28.05 
 
 
339 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  28.05 
 
 
339 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
331 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3232  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  26.96 
 
 
335 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.624237  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238126  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.96 
 
 
335 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  26.25 
 
 
336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0221  dipeptide ABC transporter, permease protein  25.92 
 
 
336 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 
339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.186938  normal  0.127201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 
341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.89 
 
 
327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.2 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
323 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
319 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  28.17 
 
 
336 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  27.23 
 
 
339 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
336 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.7 
 
 
333 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.69 
 
 
314 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.89 
 
 
327 aa  134  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.395027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  28.12 
 
 
336 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  26.25 
 
 
336 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  26.63 
 
 
339 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 
334 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4598  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.58 
 
 
319 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.930375  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1527  nickel-transporting ATPase  27.3 
 
 
338 aa  133  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.37 
 
 
334 aa  133  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.25 
 
 
336 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.39 
 
 
334 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  27.15 
 
 
335 aa  133  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.19 
 
 
345 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.19 
 
 
345 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0525112  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0183  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  26.37 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  26.37 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>