More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0521 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 123 aa  239  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  44.72 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  43.9 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  43.9 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 125 aa  124  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 123 aa  115  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  40.65 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  44.74 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  43.8 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.19 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  42.98 
 
 		 126 aa  110  4.0000000000000004e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 130 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  37.4 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 126 aa  106  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  38.84 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  37.4 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  43.22 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  46.55 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  37.5 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  41.32 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  43.44 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  40.5 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>