More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0809 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
157 aa  307  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.58219e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  73.72 
 
 
159 aa  224  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  68.39 
 
 
158 aa  212  1e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  68.39 
 
 
158 aa  212  1e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  63.46 
 
 
158 aa  206  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 
163 aa  198  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  1.29551e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 
161 aa  195  2e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.78945e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  68.39 
 
 
158 aa  194  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.82043e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  66.45 
 
 
156 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  64.05 
 
 
158 aa  190  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.27535e-05  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 
158 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.53177e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  61.94 
 
 
160 aa  187  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  4.4733e-14  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  63.58 
 
 
162 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.11465e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  58.71 
 
 
159 aa  178  3e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.37367e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  60.74 
 
 
159 aa  168  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  58 
 
 
159 aa  167  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  58 
 
 
158 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
157 aa  162  2e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  54.79 
 
 
161 aa  160  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  64.05 
 
 
164 aa  160  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.84686e-07  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 
156 aa  159  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 
158 aa  157  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 
158 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 
158 aa  157  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 
158 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 
175 aa  157  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 
158 aa  157  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 
158 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.92957e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  52.67 
 
 
175 aa  156  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  52.67 
 
 
158 aa  156  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  52.67 
 
 
175 aa  156  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 
160 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  50 
 
 
157 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  9.57781e-07  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  51.33 
 
 
175 aa  154  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  51.33 
 
 
160 aa  149  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.92256e-24 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  54.9 
 
 
158 aa  146  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.31032e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  50 
 
 
157 aa  146  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  2.29317e-06 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 
160 aa  146  1e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  50 
 
 
155 aa  145  2e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.27836e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 
160 aa  144  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 
157 aa  141  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 
158 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 
159 aa  140  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 
158 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.82345e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 
158 aa  139  1e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 
158 aa  138  2e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 
154 aa  138  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 
158 aa  137  4e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.87405e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 
162 aa  137  4e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 
164 aa  137  4e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.4894e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  52.98 
 
 
156 aa  137  8e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  1.31275e-07  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 
158 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
160 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
160 aa  135  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  2.90434e-11  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 
159 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.08338e-13  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  51.13 
 
 
160 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 
157 aa  135  3e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 
158 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.82493e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 
158 aa  134  6e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  48 
 
 
158 aa  134  7e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 
158 aa  132  1e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 
155 aa  132  2e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  5.39704e-10 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  50 
 
 
157 aa  132  2e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  49.68 
 
 
157 aa  131  4e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 
157 aa  131  4e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
160 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 
159 aa  130  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 
157 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 
152 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 
157 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 
156 aa  130  8e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 
159 aa  129  1e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  43.95 
 
 
158 aa  129  1e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 
172 aa  129  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 
158 aa  129  2e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 
158 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 
152 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  47.18 
 
 
179 aa  127  5e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 
157 aa  127  5e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  127  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  127  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  51.06 
 
 
156 aa  127  7e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 
159 aa  127  8e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 
176 aa  126  9e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 
156 aa  126  1e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  7.16767e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 
160 aa  126  1e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 
158 aa  126  1e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.33551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  55.63 
 
 
158 aa  126  1e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 
158 aa  126  1e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 
157 aa  126  1e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 
158 aa  125  2e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  55.63 
 
 
158 aa  125  2e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 
156 aa  125  2e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  6.07304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 
176 aa  125  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 
158 aa  125  2e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  55.63 
 
 
158 aa  125  2e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 
158 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 
158 aa  125  3e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  47.02 
 
 
158 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 
158 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>