More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3899 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  60.66 
 
 
184 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  56.35 
 
 
186 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  58.47 
 
 
190 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
188 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
183 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  41.45 
 
 
265 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  37.99 
 
 
188 aa  111  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  42 
 
 
182 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
186 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
177 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
181 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
181 aa  104  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
192 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
177 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
192 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 
188 aa  99  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35 
 
 
177 aa  98.2  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
166 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  40 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  35.4 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  32.26 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  32.26 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
180 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
179 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
179 aa  84.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  32.96 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2018  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  30.72 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  31.33 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  34.78 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  34.36 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.86 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.86 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.86 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.86 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  30.86 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  30.86 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2931  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.87 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.86 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  30.86 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  35.4 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  32.54 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  31.74 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  33.1 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  32.14 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
211 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3458  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185858  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  28.41 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>