More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4520 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 278 aa  564  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4518  transcriptional regulator, GntR family  40.75 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0769  transcriptional regulator, GntR family  40.75 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  30.42 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 257 aa  89  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 237 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.63 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.08 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  26.97 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1287  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  29.39 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0146  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  27.89 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 245 aa  72  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  30.64 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  27.57 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  27.57 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  25.39 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  26.96 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2178  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0464969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  28.45 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.98 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2893  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.28 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1748  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  27.62 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  25.3 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  21.34 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>