More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2043 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  100 
 
 
291 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  1.73989e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  50.35 
 
 
287 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  48.26 
 
 
301 aa  215  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  48.41 
 
 
299 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  49.48 
 
 
282 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  44.41 
 
 
288 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  49.3 
 
 
283 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.01 
 
 
288 aa  200  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  47.06 
 
 
292 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  45.49 
 
 
289 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.37 
 
 
284 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 
290 aa  165  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.93 
 
 
288 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 
289 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  38.33 
 
 
295 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  42.05 
 
 
287 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  40.89 
 
 
288 aa  146  4e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 
293 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  40.41 
 
 
303 aa  141  1e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 
294 aa  139  5e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  42.31 
 
 
285 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 
293 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  38.91 
 
 
298 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 
293 aa  131  1e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  36.39 
 
 
293 aa  131  1e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 
293 aa  130  2e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36.91 
 
 
293 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.81 
 
 
307 aa  128  1e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 
289 aa  128  1e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  40.55 
 
 
323 aa  127  2e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  45.49 
 
 
289 aa  127  2e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 
277 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 
289 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.58 
 
 
296 aa  125  8e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 
277 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  40.81 
 
 
293 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  41.52 
 
 
296 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 
289 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 
297 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.45 
 
 
315 aa  121  1e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  35.15 
 
 
281 aa  121  1e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  36.7 
 
 
302 aa  121  1e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.74 
 
 
293 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  35.47 
 
 
297 aa  120  4e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 
291 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
298 aa  118  1e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
298 aa  118  1e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34.23 
 
 
298 aa  118  1e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  36.59 
 
 
277 aa  118  1e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  2.09099e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  37.29 
 
 
302 aa  117  2e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
295 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  33.33 
 
 
347 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  34.6 
 
 
290 aa  114  1e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.52786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  34.12 
 
 
306 aa  114  2e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 
294 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
292 aa  113  4e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
294 aa  113  4e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
296 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 
293 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.4 
 
 
295 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.4 
 
 
295 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.4 
 
 
295 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
292 aa  112  7e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.23 
 
 
292 aa  112  7e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  37.19 
 
 
277 aa  112  8e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  2.18244e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  36.33 
 
 
393 aa  112  1e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.11 
 
 
373 aa  111  1e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.11 
 
 
294 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
290 aa  110  2e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  33.79 
 
 
309 aa  110  2e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.71 
 
 
339 aa  111  2e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
294 aa  110  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.47 
 
 
303 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 
300 aa  109  4e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
295 aa  110  4e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  35.27 
 
 
294 aa  109  7e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.83 
 
 
294 aa  108  8e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  35.84 
 
 
297 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  34.77 
 
 
305 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  39.91 
 
 
229 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 
294 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.91 
 
 
296 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 
294 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  41.24 
 
 
295 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.47 
 
 
294 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  32.35 
 
 
304 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
341 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5215  UspA domain protein  38.86 
 
 
284 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 
341 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  33.56 
 
 
341 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
271 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  33.66 
 
 
305 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  37.85 
 
 
274 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  33.56 
 
 
299 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.55 
 
 
310 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.33 
 
 
291 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4828  hypothetical protein  34.36 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.45 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  35.93 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>