More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0121 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  100 
 
 
305 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  63.91 
 
 
314 aa  363  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  61.51 
 
 
318 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2485  prephenate dehydratase  58.42 
 
 
349 aa  345  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  58.52 
 
 
315 aa  341  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  59.48 
 
 
306 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  57.28 
 
 
317 aa  328  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  56.27 
 
 
315 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  57.52 
 
 
324 aa  315  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4522  prephenate dehydratase  51.92 
 
 
318 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  53.49 
 
 
326 aa  292  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3187  Prephenate dehydratase  52.58 
 
 
322 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.019372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  50.66 
 
 
316 aa  290  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  50.49 
 
 
327 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0268  Prephenate dehydratase  53.44 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  52.33 
 
 
305 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5662  prephenate dehydratase  51.59 
 
 
312 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0100  Prephenate dehydratase  54.46 
 
 
300 aa  269  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0377  Prephenate dehydratase  47.63 
 
 
335 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5032  prephenate dehydratase  53.87 
 
 
318 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13872  prephenate dehydratase  49.04 
 
 
321 aa  261  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1145  prephenate dehydratase  48.23 
 
 
309 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0149983  normal  0.0340431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01190  prephenate dehydratase  52.96 
 
 
301 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.70392  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0245  Prephenate dehydratase  50.32 
 
 
314 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00775166  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5034  prephenate dehydratase  48.72 
 
 
315 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431184  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5122  prephenate dehydratase  48.72 
 
 
315 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5415  prephenate dehydratase  48.72 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0218  Prephenate dehydratase  52.73 
 
 
314 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  47.08 
 
 
277 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  47.08 
 
 
277 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  47.08 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06790  prephenate dehydratase  42.07 
 
 
325 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.299471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  44.28 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  39.29 
 
 
282 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  39.93 
 
 
278 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  40.37 
 
 
280 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  42.86 
 
 
276 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  47.46 
 
 
275 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  44.85 
 
 
371 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  43.73 
 
 
386 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  40.81 
 
 
283 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  39.49 
 
 
286 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0145  Prephenate dehydratase  44.03 
 
 
311 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  40.65 
 
 
367 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  40.65 
 
 
364 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.65 
 
 
364 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  40.65 
 
 
364 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  40.65 
 
 
364 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  43.75 
 
 
280 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  40.65 
 
 
364 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  40.65 
 
 
364 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  38.6 
 
 
356 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  39.57 
 
 
364 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  38.93 
 
 
283 aa  175  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  39.93 
 
 
365 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  38.91 
 
 
359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  38.97 
 
 
373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  40.65 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  39.29 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  39.57 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  40.88 
 
 
360 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  43.01 
 
 
372 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  40.58 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  39.05 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  35.12 
 
 
303 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  34.69 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  38.55 
 
 
359 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  40.07 
 
 
283 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  40.07 
 
 
283 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  39.29 
 
 
283 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  37.59 
 
 
382 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  35.53 
 
 
274 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  39.29 
 
 
283 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  34.4 
 
 
284 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  38.99 
 
 
283 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.57 
 
 
360 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1067  Prephenate dehydratase  39.71 
 
 
288 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  39.29 
 
 
283 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  39.5 
 
 
283 aa  168  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  40.5 
 
 
282 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1096  Prephenate dehydratase  39.35 
 
 
288 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  38.93 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4552  prephenate dehydratase  38.93 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  38.97 
 
 
279 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  37.87 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.11 
 
 
371 aa  165  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  39.15 
 
 
283 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0633  Prephenate dehydratase  42.09 
 
 
285 aa  165  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  38.75 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  36.08 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  43.46 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.78 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  37.73 
 
 
277 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  38.75 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  36.03 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  34.71 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  38.38 
 
 
382 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  38.97 
 
 
279 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.73 
 
 
358 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.78 
 
 
365 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>