More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0001 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
721 aa  1454    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  82.05 
 
 
480 aa  589  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  80.65 
 
 
582 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  83.67 
 
 
527 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  66.6 
 
 
615 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  76.13 
 
 
570 aa  555  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  80.87 
 
 
652 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  77.08 
 
 
528 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  62.89 
 
 
591 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  64.57 
 
 
587 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  73.58 
 
 
534 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  74.13 
 
 
518 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  77.91 
 
 
490 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  72.65 
 
 
597 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  68.91 
 
 
489 aa  525  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  74.58 
 
 
577 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  75.57 
 
 
468 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  73.07 
 
 
474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  72.78 
 
 
473 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  73.3 
 
 
562 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  75.21 
 
 
476 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  70.81 
 
 
509 aa  506  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  63.91 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  70.97 
 
 
494 aa  505  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  71.55 
 
 
495 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  71.55 
 
 
495 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  71.55 
 
 
495 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  76.22 
 
 
527 aa  502  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  72.13 
 
 
557 aa  502  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  71.26 
 
 
566 aa  495  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  75.14 
 
 
584 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  70.37 
 
 
515 aa  486  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  71.26 
 
 
507 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  69.71 
 
 
490 aa  465  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  66.01 
 
 
506 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  68.88 
 
 
565 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  62.28 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  59.83 
 
 
446 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  60.28 
 
 
446 aa  436  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  61.47 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  61.47 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  61.47 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  61.47 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  61.47 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  61.47 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  61.47 
 
 
446 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  57.65 
 
 
450 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  59.94 
 
 
450 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  61.18 
 
 
446 aa  428  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  60.88 
 
 
446 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  58.46 
 
 
457 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  58.46 
 
 
457 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.52 
 
 
454 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.04 
 
 
446 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  53.44 
 
 
443 aa  413  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  57.64 
 
 
440 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  59.23 
 
 
441 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  55.86 
 
 
442 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.19 
 
 
463 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.46 
 
 
458 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.6 
 
 
443 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  57.91 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.67 
 
 
450 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.35 
 
 
454 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  61.15 
 
 
443 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.47 
 
 
444 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  55.16 
 
 
451 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  58.26 
 
 
445 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.89 
 
 
449 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.52 
 
 
453 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  55.03 
 
 
453 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  58.6 
 
 
478 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  55.03 
 
 
453 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  56.72 
 
 
472 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  54.39 
 
 
481 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  52.02 
 
 
445 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  55.16 
 
 
480 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.51 
 
 
439 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  50.12 
 
 
500 aa  368  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.04 
 
 
539 aa  365  1e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  55.03 
 
 
456 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  51.95 
 
 
449 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.03 
 
 
461 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  52.66 
 
 
453 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  51.34 
 
 
459 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.93 
 
 
447 aa  359  9e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  51.68 
 
 
450 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  57.27 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.1 
 
 
439 aa  358  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  49.86 
 
 
453 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  49.59 
 
 
453 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  52.35 
 
 
460 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  50.56 
 
 
460 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  52.04 
 
 
458 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  50.57 
 
 
482 aa  349  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.56 
 
 
503 aa  346  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  49.86 
 
 
460 aa  344  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  50.88 
 
 
454 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  51.17 
 
 
456 aa  341  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  48.65 
 
 
440 aa  334  3e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>