287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1431 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  100 
 
 		 153 aa  300  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  59.85 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  66.06 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  57.25 
 
 		 135 aa  149  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  51.63 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  59.38 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  57.94 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  57.94 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  58.4 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  58.4 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  57.6 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  58.4 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  58.4 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  58.59 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  59.06 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  62.73 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  62.73 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  50.33 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  57.89 
 
 		 127 aa  144  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 		 203 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  53.68 
 
 		 139 aa  144  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  57.03 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  55.48 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  51.33 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  58.14 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  57.81 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  50.71 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  50.67 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  57.48 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  51.85 
 
 		 143 aa  141  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  57.48 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  57.81 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  51.75 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  44.03 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  52.45 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  73.56 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  73.56 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  49.09 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  52.08 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  54.03 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  54.03 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  54.03 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  54.03 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  54.03 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  54.03 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  61.32 
 
 		 174 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  54.03 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  54.03 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  70.79 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  70.79 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  70.79 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  52.38 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  52.38 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  52.38 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  52.38 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  52.38 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  52.38 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  52 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  72.62 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1708  flagellar motor switch protein  56 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  49.21 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  51.16 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  62.86 
 
 		 111 aa  133  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  71.08 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  68.97 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  55.86 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  58.42 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  48.92 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  48.18 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  47.48 
 
 		 137 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  51.56 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  51.56 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  55.96 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  51.56 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  51.56 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  51.56 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  48.2 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  48.37 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  68.67 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  51.56 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  56.31 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  67.47 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  63.22 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  63.22 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  43.95 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  46.76 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  64.29 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  44.3 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  50.79 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  47.37 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  43.62 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  43.62 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  47.37 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  62.65 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  66.27 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>