60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2527 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  687    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  48.72 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  43.93 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  37.8 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  35.01 
 
 
339 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  34.97 
 
 
294 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  34.5 
 
 
322 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  56.91 
 
 
357 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  31.33 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  31.66 
 
 
349 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  32.3 
 
 
317 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  45.93 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  30.25 
 
 
338 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  25.15 
 
 
358 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  29.38 
 
 
366 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  28.27 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  38.57 
 
 
333 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  29.8 
 
 
434 aa  86.7  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  36.69 
 
 
335 aa  86.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  40 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  26.65 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  39.02 
 
 
437 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  39.02 
 
 
437 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  28.65 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  41.94 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.82 
 
 
554 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  44.55 
 
 
1048 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.21 
 
 
547 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  38.89 
 
 
251 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  38.89 
 
 
251 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  38.89 
 
 
251 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  45.68 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.57 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  40.66 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  35.35 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  35.54 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  40.91 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  39.53 
 
 
289 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.89 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.38 
 
 
321 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5762  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  30.77 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  29.28 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  34.65 
 
 
171 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  34.65 
 
 
171 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  30.07 
 
 
365 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  33.04 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  33.04 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  30.17 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 
682 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1672  hypothetical protein  32.43 
 
 
234 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.658702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5081  hypothetical protein  33.06 
 
 
232 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  22.74 
 
 
319 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  30.05 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10325  hypothetical protein  30.83 
 
 
220 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0423  hypothetical protein  33.71 
 
 
201 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  26.44 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  29.81 
 
 
767 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0414  hypothetical protein  33.71 
 
 
201 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0402  hypothetical protein  33.71 
 
 
199 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0472134  normal  0.221882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>