51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0288 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  724    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  66.96 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  67.24 
 
 		 350 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  64.72 
 
 		 356 aa  465  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  60.29 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  58.14 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  58.38 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  58.36 
 
 		 343 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  56.72 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  53.91 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  48.22 
 
 		 347 aa  341  9e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  46.09 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  46.11 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  42.22 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  43.91 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  38.3 
 
 		 344 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  37.79 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  36.34 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  35.29 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  36.14 
 
 		 348 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.12 
 
 		 344 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  34.44 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.48 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  32.96 
 
 		 471 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  30 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  25.56 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  25.77 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  26.99 
 
 		 370 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  28.16 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  23.66 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.96 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  23.65 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  22.92 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  27.53 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  23.43 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  22.22 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  21.51 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  21.52 
 
 		 372 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  20.69 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1303  hypothetical protein  21.38 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  22.71 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  22.3 
 
 		 366 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  25.91 
 
 		 332 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  22.26 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00204  hypothetical protein  23.14 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  22.58 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3425  hypothetical protein  31.46 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.143139  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2715  hypothetical protein  23.87 
 
 		 238 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  22.95 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  22.04 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>