129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1613 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  100 
 
 
155 aa  306  5e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  56.69 
 
 
160 aa  187  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1748  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.04 
 
 
159 aa  156  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  38.22 
 
 
161 aa  122  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  41.21 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  37.75 
 
 
172 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0664  cation antiporter  40.82 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  33.85 
 
 
198 aa  87.8  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1772  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  40.79 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.16 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  35.16 
 
 
175 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.67 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.67 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  33.77 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2713  cation antiporter  35.29 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0866  cation antiporter  38.46 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.549257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  34.39 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12120  cation antiporter  31.87 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000445781  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5159  cation antiporter  33.97 
 
 
344 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  33.06 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.11 
 
 
421 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0948  membrane bound hydrogenase subunit mbhA  35.59 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0174766  normal  0.241489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  32.89 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  34.91 
 
 
349 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.97 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  29.22 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.92 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.65 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  37.5 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  27.92 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  45.24 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.33 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  27.69 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0579  cation antiporter  28 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0216682  decreased coverage  0.00989196 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.41 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1641  cation antiporter  31.06 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296097  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0981  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.64 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.333732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0878  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.67 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0478355  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0796  cation antiporter  33.08 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0900  cation antiporter  29.63 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  28.46 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.1 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  29.2 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.94 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  33.09 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2281  cation antiporter  36 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  32.41 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.95 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  32.58 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  44.59 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.03 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.937778  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0487  cation antiporter  31.25 
 
 
219 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.700511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1287  cation antiporter  30.08 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.412588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  33.1 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2669  cation antiporter  32.37 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0884  cation antiporter  39.44 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.207423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  31.48 
 
 
115 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  36.05 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.62 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1541  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.81 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0194203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0818  hypothetical protein  27.43 
 
 
177 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676799  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  30.56 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  32.63 
 
 
158 aa  54.3  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2852  cation antiporter  32.61 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3279  cation antiporter  26.85 
 
 
177 aa  54.3  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300604  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.73 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0738  hypothetical protein  30.65 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  35.29 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  22.73 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.11 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4321  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.97 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  38.1 
 
 
117 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0494  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.3 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50700  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  32.97 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968522 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.77 
 
 
168 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.32 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1007  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.14 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.32 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1444  cation antiporter  29.7 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0242697  normal  0.798428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0911  cation antiporter  24.26 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000489084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.9 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0673  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.34 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1127  cation antiporter  27.88 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0318797  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  41.54 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1916  cation antiporter  34.02 
 
 
123 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1681  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.18 
 
 
167 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.115718  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.29 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3732  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.87 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3228  cation antiporter  31.96 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357833  normal  0.10226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3948  cation antiporter  36.51 
 
 
171 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01530  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  32.14 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0151  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  29.69 
 
 
162 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1286  cation antiporter  28.71 
 
 
162 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.964773  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3292  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.8 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.630258  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1006  cation antiporter  31.33 
 
 
184 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3661  cation antiporter  27.05 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  28.57 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1032  hypothetical protein  31.94 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0676614 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>