37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3580 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1044    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  32.11 
 
 		 514 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  28.79 
 
 		 508 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  29.71 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  23.81 
 
 		 527 aa  93.6  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  28.74 
 
 		 465 aa  93.2  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  28.45 
 
 		 465 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  32.62 
 
 		 457 aa  89  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  33.93 
 
 		 466 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  30.56 
 
 		 617 aa  89  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  34 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  32.41 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  32.41 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  32.21 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  27.27 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  31.54 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  25.27 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  28.8 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  34.44 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  27.81 
 
 		 369 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  24.14 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  32.73 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  29.17 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  26.9 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  24.68 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  26.98 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  26.32 
 
 		 363 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  23.86 
 
 		 374 aa  57  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  24.68 
 
 		 555 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  24.52 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  24.53 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  28.41 
 
 		 461 aa  53.5  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  26.35 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  25.12 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  29.25 
 
 		 513 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1538  hypothetical protein  27.92 
 
 		 476 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  23.03 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>