More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0060 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  100 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.24 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  46.43 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  37.84 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  41.35 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  39.37 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  44.07 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.95 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.6 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  39.36 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  46.19 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  41.51 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  41.1 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  37.94 
 
 		 289 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  36.76 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  40.95 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  40 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  37.74 
 
 		 529 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  40.66 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  42.21 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  35.74 
 
 		 329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  39.44 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  39.44 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  46.73 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  36.5 
 
 		 335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  39.44 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  41.5 
 
 		 422 aa  162  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  38.61 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  43.32 
 
 		 268 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  37.82 
 
 		 305 aa  161  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  35.55 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  38.98 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  36.5 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  39.3 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  45.03 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  42.98 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  37.04 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  41.45 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  42.64 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  38.46 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  37.64 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  41.25 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  35.52 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  35.36 
 
 		 299 aa  158  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  39.66 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  44.5 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  38.67 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  39.15 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  36.68 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  37.01 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  35.77 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  41.38 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  38.37 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  36.72 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  37.82 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  41.5 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  38.11 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  39.42 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  37.69 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  39.7 
 
 		 472 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  39 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  37.59 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  41.31 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  42.53 
 
 		 401 aa  155  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.92 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  39.79 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  40.53 
 
 		 358 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  39.26 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  38.82 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  36.59 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  36.89 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  43.16 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  36.89 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.96 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  44.04 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  39 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.96 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  38.59 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  42.78 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  39.62 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  38.34 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  36.72 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  38.55 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  38.67 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2844  parB-like partition protein  39.85 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  44.09 
 
 		 311 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  38.25 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  40.74 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  37.4 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 		 367 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  45.05 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  36.26 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  38.49 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  41.4 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  38.17 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  41.15 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  38.32 
 
 		 377 aa  152  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  42.42 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  34.78 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>