128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13572 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13572  PPE family protein  100 
 
 
479 aa  952    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000542589 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  37.17 
 
 
655 aa  210  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0761  hypothetical protein  36.18 
 
 
401 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11581  PPE family protein  57.49 
 
 
760 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.912214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13856  hypothetical protein  38.38 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13165  PPE family protein  55.43 
 
 
409 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  57.47 
 
 
3166 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0401  hypothetical protein  38.15 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.530994  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10895  PPE family protein  60.11 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0951157  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13566  PPE family protein  52.43 
 
 
582 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.514261  hitchhiker  0.0000000713233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12627  PPE family protein  56.65 
 
 
580 aa  140  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000062358  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0248  PE-PPE-like protein  36.67 
 
 
377 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0258  hypothetical protein  36.67 
 
 
377 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0307728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0238  hypothetical protein  36.67 
 
 
377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.107724  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11771  PPE family protein  57.47 
 
 
975 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.49393e-28  hitchhiker  0.0000000153091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11838  PPE family protein  55.62 
 
 
409 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11946  PPE family protein  58.08 
 
 
1457 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.515956  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10447  PPE family protein  55.62 
 
 
487 aa  136  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.925376  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0276  hypothetical protein  36.67 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13145  PPE family protein  56.89 
 
 
391 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.213785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11392  PPE family protein  47.37 
 
 
396 aa  134  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10360  PPE family protein  57.65 
 
 
3295 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.683224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10392  PPE family protein  56 
 
 
443 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000154935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10769  PPE family protein  55.25 
 
 
645 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000490344  normal  0.972574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13513  PPE family protein  45.56 
 
 
392 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13157  PPE family protein  54.25 
 
 
380 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11220  PPE family protein  50 
 
 
391 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.540836  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12376  PPE family protein  58.08 
 
 
391 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.84927e-25  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13565  PPE family protein  50.31 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000859509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11832  PPE family protein  50 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000026976  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11839  PPE family protein  50.9 
 
 
470 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1735  PE-PPE-like protein  36.7 
 
 
307 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1782  hypothetical protein  36.7 
 
 
307 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1714  hypothetical protein  36.7 
 
 
307 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11720  PPE family protein  52.1 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13376  PPE family protein  64 
 
 
2532 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0812485  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13591  PPE family protein  48.33 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000128496  normal  0.122271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11817  PPE family protein  52.94 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13386  PPE family protein  58.44 
 
 
3787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000441987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11208  hypothetical protein  33.98 
 
 
359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11820  PPE family protein  52.94 
 
 
350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.261988  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12906  PPE family protein  53.29 
 
 
408 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00379008  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10933  PPE family protein  53.25 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11157  PPE family protein  60 
 
 
636 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.38215e-17  normal  0.405765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12783  PPE family protein  50 
 
 
382 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11819  PPE family protein  58 
 
 
393 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11837  PPE family protein  53.33 
 
 
403 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  61.25 
 
 
1013 aa  106  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13180  PPE family protein  60 
 
 
590 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.78339e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11721  PPE family protein  52.8 
 
 
394 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11057  PPE family protein  56.67 
 
 
391 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.824067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13652  PPE family protein  56.76 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134565  hitchhiker  0.000334929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11833  PPE family protein  56.89 
 
 
463 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031557  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12781  PPE family protein  54.67 
 
 
394 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000422215  normal  0.399199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4518  hypothetical protein  35.53 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3103  hypothetical protein  36.63 
 
 
413 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0463748  normal  0.241935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  35.29 
 
 
528 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3371  hypothetical protein  34.83 
 
 
431 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21394  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11193  PPE family protein  42.26 
 
 
346 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1838  hypothetical protein  35 
 
 
435 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12458  PPE family protein  34.13 
 
 
194 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.755851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13465  PPE family protein  37.04 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213323  hitchhiker  0.000182876 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3864  hypothetical protein  29.39 
 
 
448 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0367973  normal  0.130474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13459  PPE family protein  35.26 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.091e-18  hitchhiker  0.000474891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12382  PPE family protein  58.05 
 
 
615 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105692  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  33.51 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  33.33 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2535  hypothetical protein  36.45 
 
 
409 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13037  PPE family protein  39.22 
 
 
435 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.52144e-113  hitchhiker  0.00208652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13033  PPE family protein  39.22 
 
 
434 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.2921e-59  normal  0.0390657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4723  hypothetical protein  34.76 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795811  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13381  PPE family protein  56.03 
 
 
647 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00213792  normal  0.0214486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12140  PPE family protein  42.59 
 
 
213 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.95332e-49  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0327  PPE protein  34.18 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.821755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3250  hypothetical protein  31.22 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0325  PPE protein  38.12 
 
 
540 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.500492  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10259  PPE family protein  33.11 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0388917 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13462  PPE family protein  32.74 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119714  decreased coverage  0.000040288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10459  PPE family protein  36.6 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  28.96 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  28.96 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  28.96 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10097  PPE family protein  37.16 
 
 
463 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11416  PPE family protein  31.21 
 
 
539 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793928  normal  0.128386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  28.4 
 
 
502 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13908  PPE family protein  35.75 
 
 
368 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00117141  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13458  hypothetical protein  33.95 
 
 
176 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423938  hitchhiker  0.0000923952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4951  PE-PPE-like protein  31.67 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0809948  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5039  hypothetical protein  31.67 
 
 
413 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0487726  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5332  hypothetical protein  31.67 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12379  PPE family protein  57.06 
 
 
613 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000086115  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0041  hypothetical protein  30.43 
 
 
494 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10293  PPE family protein  40.54 
 
 
513 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.312861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  33.89 
 
 
588 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3106  hypothetical protein  32.18 
 
 
411 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.929764  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10287  PPE family protein  37.84 
 
 
536 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.80093e-35  normal  0.372086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2967  hypothetical protein  35.71 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550701  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4726  hypothetical protein  29.55 
 
 
526 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1011  hypothetical protein  28.83 
 
 
427 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0659585 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>