191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2458 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
724 aa  1395    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  34.94 
 
 
748 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  35.1 
 
 
748 aa  347  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  29.58 
 
 
734 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  37.02 
 
 
798 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  33.89 
 
 
792 aa  283  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  33.29 
 
 
769 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  33.45 
 
 
816 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  32.91 
 
 
591 aa  126  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.79 
 
 
757 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.77 
 
 
794 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.26 
 
 
773 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.04 
 
 
778 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.07 
 
 
791 aa  114  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  36.13 
 
 
611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.91 
 
 
773 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.03 
 
 
818 aa  109  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.84 
 
 
780 aa  109  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.93 
 
 
773 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.34 
 
 
809 aa  108  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  28.54 
 
 
694 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.17 
 
 
761 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.58 
 
 
752 aa  107  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.12 
 
 
773 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.8 
 
 
773 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.29 
 
 
786 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  22.4 
 
 
773 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.41 
 
 
772 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.41 
 
 
773 aa  99  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.41 
 
 
772 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  31.99 
 
 
514 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  28.65 
 
 
503 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.89 
 
 
654 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  27.39 
 
 
469 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  36.2 
 
 
711 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  36.87 
 
 
519 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  36.09 
 
 
872 aa  96.3  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  27.54 
 
 
546 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  27.65 
 
 
672 aa  93.6  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.13 
 
 
759 aa  91.3  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.97 
 
 
896 aa  90.9  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.56 
 
 
837 aa  90.1  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.3 
 
 
840 aa  90.5  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  29.81 
 
 
493 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  34.29 
 
 
489 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  24.47 
 
 
604 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  27.25 
 
 
494 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  27 
 
 
717 aa  87.4  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.83 
 
 
775 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  24.39 
 
 
609 aa  85.9  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.11 
 
 
798 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  25.91 
 
 
671 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  28.33 
 
 
684 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  33.33 
 
 
562 aa  84.7  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  27.74 
 
 
684 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1425  ComEC/Rec2-related protein  22.76 
 
 
678 aa  84.3  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  28.66 
 
 
872 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3192  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.33 
 
 
682 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  25.9 
 
 
706 aa  82.4  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  25.51 
 
 
551 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  21.88 
 
 
636 aa  82  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  27.12 
 
 
679 aa  81.6  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.57 
 
 
795 aa  80.9  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  25.87 
 
 
708 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  29.43 
 
 
516 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0848  ComEC/Rec2-related protein  26.82 
 
 
689 aa  80.1  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  26.18 
 
 
593 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.77 
 
 
796 aa  79.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  23.27 
 
 
674 aa  78.6  0.0000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  26.15 
 
 
551 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.01 
 
 
770 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  26.19 
 
 
706 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.42 
 
 
797 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.17 
 
 
771 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  37.2 
 
 
829 aa  77.4  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  27.22 
 
 
718 aa  75.5  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  32.78 
 
 
798 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.77 
 
 
790 aa  75.1  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  26.8 
 
 
879 aa  74.7  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  26 
 
 
694 aa  74.7  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  26.9 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.4 
 
 
722 aa  74.3  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  31.58 
 
 
656 aa  74.3  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  23.97 
 
 
795 aa  73.9  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  32.51 
 
 
784 aa  73.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  29.85 
 
 
799 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  34.67 
 
 
800 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  24.1 
 
 
757 aa  72.4  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  26.34 
 
 
762 aa  72.4  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  31.25 
 
 
710 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.35 
 
 
806 aa  71.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  28.11 
 
 
626 aa  71.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0680  hypothetical protein  23.69 
 
 
735 aa  71.2  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.85 
 
 
777 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3468  ComEC/Rec2-related protein  37.35 
 
 
806 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183145  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.75 
 
 
770 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.93 
 
 
808 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3512  ComEC/Rec2-related protein  33.96 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3584  ComEC/Rec2-related protein  33.96 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  0.0166821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  35.66 
 
 
821 aa  68.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>