More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1840 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1840  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  338  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2584  pentapeptide repeat protein  51.7 
 
 
171 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.14087  normal  0.252585 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4862  pentapeptide repeat-containing protein  46.39 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2759  pentapeptide repeat-containing protein  48.19 
 
 
164 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0592  pentapeptide repeat protein  43.38 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0575  pentapeptide repeat protein  43.38 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1115  pentapeptide repeat protein  45.27 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  39.76 
 
 
169 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0362  pentapeptide repeat-containing protein  40.61 
 
 
163 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.571178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4307  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 
182 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.154552  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  38.71 
 
 
170 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1219  hypothetical protein  40.13 
 
 
169 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1263  hypothetical protein  37.42 
 
 
169 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 
162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  36.77 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  37.01 
 
 
170 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  36.77 
 
 
170 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16951  hypothetical protein  37.72 
 
 
198 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.62237 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  38.73 
 
 
170 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  38.73 
 
 
170 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  35.88 
 
 
168 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15511  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 
186 aa  90.9  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2129  pentapeptide repeat-containing protein  32.9 
 
 
165 aa  90.9  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.283688  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2954  pentapeptide repeat protein  37.98 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.916978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1609  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15361  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 
186 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15111  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
192 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.783575  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3470  pentapeptide repeat-containing protein  37.41 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1053  hypothetical protein  30.64 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11471  hypothetical protein  30.06 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11461  hypothetical protein  30.06 
 
 
172 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
172 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1448  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 
186 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03791  pentapeptide repeat-containing protein  39.47 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0921  pentapeptide repeat-containing protein  32.91 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2525  pentapeptide repeat protein  35.2 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07051  pentapeptide repeat-containing protein  29.61 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186987  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1285  hypothetical protein  35.54 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.967033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0856  hypothetical protein  36.64 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11321  hypothetical protein  29.48 
 
 
172 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8317  predicted protein  42.73 
 
 
114 aa  82  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0135698  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17771  pentapeptide repeat-containing protein  30.19 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0649  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3581  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11531  hypothetical protein  31.41 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0502913  normal  0.0854137 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06761  pentapeptide repeat-containing protein  30.18 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.168299  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_10544  predicted protein  40.16 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00165486  hitchhiker  0.0000000637684 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0712  hpothetical protein  27.49 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15481  hypothetical protein  27.49 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07151  pentapeptide repeat-containing protein  34.75 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.102033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1536  hypothetical protein  30.95 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.916018  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0313  hypothetical protein  29.7 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.967815  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11313  predicted protein  40.46 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.129582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3657  pentapeptide repeat-containing protein  33.61 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1185  hypothetical protein  34.19 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16121  hypothetical protein  32.82 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.385195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1361  hypothetical protein  31.54 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14041  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276957  normal  0.0592863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0734  pentapeptide repeat-containing protein  33.09 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19861  hypothetical protein  29.45 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.028924 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55176  predicted protein  30.39 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
540 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
533 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  38.33 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07611  pentapeptide repeat-containing protein  28.99 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  hitchhiker  0.00156438 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10537  predicted protein  33.33 
 
 
125 aa  62.4  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0914569  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.4 
 
 
517 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  39.82 
 
 
309 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0089  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 
204 aa  60.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  38.38 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
216 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07131  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 
190 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
225 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11235  predicted protein  36.28 
 
 
109 aa  58.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  27.46 
 
 
389 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  31.9 
 
 
263 aa  58.2  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  29.46 
 
 
441 aa  57.8  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  37.76 
 
 
215 aa  57.8  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  32.67 
 
 
844 aa  57.4  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 
447 aa  57.4  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.89 
 
 
214 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  28.17 
 
 
734 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 
710 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  31.54 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  32.61 
 
 
315 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  31.4 
 
 
234 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  33.66 
 
 
299 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  36.26 
 
 
213 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 
179 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  32.23 
 
 
291 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 
355 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  33.64 
 
 
745 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.86 
 
 
333 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.16 
 
 
442 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>