88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1116 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  100 
 
 		 679 aa  1403    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.84 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  34.82 
 
 		 583 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.71 
 
 		 559 aa  311  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  34.24 
 
 		 844 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  33.7 
 
 		 847 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  33.7 
 
 		 843 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  32.47 
 
 		 844 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.83 
 
 		 559 aa  293  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  29.39 
 
 		 606 aa  248  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  37.08 
 
 		 792 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.05 
 
 		 668 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.49 
 
 		 914 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.67 
 
 		 578 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  29.83 
 
 		 578 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4114  hypothetical protein  43.5 
 
 		 186 aa  161  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  30.63 
 
 		 436 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  32.23 
 
 		 371 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  26.21 
 
 		 549 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.89 
 
 		 542 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  29.35 
 
 		 454 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  33 
 
 		 796 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  27.75 
 
 		 636 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  31.87 
 
 		 564 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.62 
 
 		 663 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  30.34 
 
 		 751 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  32.1 
 
 		 735 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  48.72 
 
 		 712 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  27.61 
 
 		 755 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  28.07 
 
 		 671 aa  104  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  33.16 
 
 		 778 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  26.96 
 
 		 605 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  27.4 
 
 		 605 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  27.6 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  31 
 
 		 880 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  25.98 
 
 		 605 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  25.13 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  25.13 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  26.34 
 
 		 606 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  26.34 
 
 		 606 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  26.34 
 
 		 609 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  26.34 
 
 		 609 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  26.34 
 
 		 609 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  31.84 
 
 		 716 aa  72  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4085  hypothetical protein  28.79 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.232051 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  28.21 
 
 		 393 aa  66.6  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.46 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  23.64 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  23.64 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  28 
 
 		 653 aa  62  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  33.09 
 
 		 201 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0882  hypothetical protein  29.29 
 
 		 378 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.96 
 
 		 698 aa  58.9  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  26.35 
 
 		 853 aa  58.5  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  30.72 
 
 		 197 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  28.87 
 
 		 367 aa  55.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  24.89 
 
 		 609 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1222  hypothetical protein  26.78 
 
 		 354 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  24.89 
 
 		 609 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  24.52 
 
 		 655 aa  55.1  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.85 
 
 		 568 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.26 
 
 		 421 aa  53.9  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  26.14 
 
 		 412 aa  53.9  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  28.47 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  28.47 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  28.47 
 
 		 431 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  22.56 
 
 		 810 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.67 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  30.07 
 
 		 197 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  29.63 
 
 		 201 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  25.14 
 
 		 803 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  26.09 
 
 		 629 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5841  hypothetical protein  31.34 
 
 		 197 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0796371  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  28.91 
 
 		 205 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.05 
 
 		 502 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.75 
 
 		 410 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  24.79 
 
 		 498 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  25 
 
 		 805 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.2 
 
 		 481 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  25 
 
 		 899 aa  47.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  22.71 
 
 		 734 aa  47.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  20.68 
 
 		 729 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  25.25 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  26.67 
 
 		 539 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  24.17 
 
 		 678 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  26.09 
 
 		 743 aa  45.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0694  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.71 
 
 		 333 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 		 743 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>