43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4918 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  100 
 
 
755 aa  1545    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  56.34 
 
 
636 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  50.7 
 
 
454 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  45.81 
 
 
606 aa  323  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.09 
 
 
668 aa  137  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  29.15 
 
 
844 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  29.54 
 
 
847 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  29.54 
 
 
843 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  28.44 
 
 
844 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.12 
 
 
559 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.5 
 
 
559 aa  129  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  29.3 
 
 
583 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  28.98 
 
 
564 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  28.93 
 
 
436 aa  114  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  26.11 
 
 
371 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.61 
 
 
679 aa  108  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  26.38 
 
 
712 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  33.03 
 
 
792 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  26.81 
 
 
735 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.08 
 
 
568 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.03 
 
 
796 aa  98.2  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  26.46 
 
 
914 aa  94.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  27.27 
 
 
751 aa  94.4  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.53 
 
 
578 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.93 
 
 
663 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  29.18 
 
 
549 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  29.88 
 
 
578 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  25.26 
 
 
671 aa  80.5  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.73 
 
 
542 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  29.37 
 
 
716 aa  74.7  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  24.61 
 
 
880 aa  72  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  29.67 
 
 
778 aa  61.6  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  25.81 
 
 
605 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  24.42 
 
 
605 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  24.42 
 
 
606 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  24.42 
 
 
606 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  24.34 
 
 
609 aa  54.7  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  24.34 
 
 
609 aa  54.3  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  24.34 
 
 
609 aa  54.3  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  24.34 
 
 
606 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  24.34 
 
 
606 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  24.88 
 
 
605 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  22.58 
 
 
605 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>