59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0046 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
568 aa  1114    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  48.84 
 
 
679 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.42 
 
 
559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  32.16 
 
 
847 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  32.16 
 
 
843 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  32.67 
 
 
844 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  31.68 
 
 
844 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  31.16 
 
 
583 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.44 
 
 
559 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.14 
 
 
668 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.22 
 
 
578 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  32.93 
 
 
549 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  30.43 
 
 
578 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  36.89 
 
 
792 aa  144  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.67 
 
 
542 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.39 
 
 
663 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  32.5 
 
 
371 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  26.87 
 
 
436 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  29.71 
 
 
454 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  28.39 
 
 
636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  40 
 
 
712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  38.69 
 
 
735 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  29.65 
 
 
914 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.62 
 
 
796 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  30.26 
 
 
751 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  32.92 
 
 
606 aa  102  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  28.37 
 
 
755 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  27.57 
 
 
564 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  27.55 
 
 
671 aa  97.1  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  33.49 
 
 
778 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  27.51 
 
 
605 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  27.3 
 
 
880 aa  80.9  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  25.38 
 
 
605 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  30.11 
 
 
605 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  24.18 
 
 
605 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  26.41 
 
 
606 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  30.41 
 
 
716 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  26.41 
 
 
606 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  25.97 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  25.97 
 
 
606 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  25.97 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  25.97 
 
 
606 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  25.97 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1889  protein of unknown function DUF55  35.06 
 
 
373 aa  60.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.39 
 
 
568 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  28.81 
 
 
805 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0694  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.92 
 
 
333 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  26.25 
 
 
655 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1222  hypothetical protein  34.25 
 
 
354 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.26 
 
 
290 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1832  protein of unknown function DUF55  25.4 
 
 
156 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  26.42 
 
 
810 aa  47  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  25 
 
 
609 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  25 
 
 
609 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  29.17 
 
 
803 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  26.26 
 
 
734 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  24.58 
 
 
698 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4085  hypothetical protein  27.47 
 
 
377 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.232051 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.58 
 
 
278 aa  43.9  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>