52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4260 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  100 
 
 		 778 aa  1580    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.18 
 
 		 663 aa  117  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  31.66 
 
 		 843 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  31.66 
 
 		 847 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  31.66 
 
 		 844 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.8 
 
 		 559 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  33.64 
 
 		 844 aa  114  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  24.6 
 
 		 880 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.18 
 
 		 578 aa  108  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.75 
 
 		 559 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.98 
 
 		 751 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  29.9 
 
 		 792 aa  105  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.59 
 
 		 668 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  38.66 
 
 		 578 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  50.51 
 
 		 712 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40.35 
 
 		 796 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  33.16 
 
 		 679 aa  100  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  40 
 
 		 735 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  32.03 
 
 		 716 aa  98.2  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  37.19 
 
 		 549 aa  98.2  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.24 
 
 		 542 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  34.59 
 
 		 583 aa  96.3  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  33.91 
 
 		 606 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  33.91 
 
 		 609 aa  95.5  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  33.91 
 
 		 609 aa  95.5  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  33.91 
 
 		 606 aa  95.5  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 606 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 609 aa  94  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  32.76 
 
 		 606 aa  94  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.49 
 
 		 568 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  29.32 
 
 		 605 aa  92  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  33.91 
 
 		 605 aa  92  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  30.41 
 
 		 605 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  31.11 
 
 		 914 aa  88.6  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  29.9 
 
 		 605 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  33.18 
 
 		 671 aa  81.3  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  31.18 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  30.69 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  30.73 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  28.84 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  28.57 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  29.67 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  27.96 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 568 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  29.65 
 
 		 781 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.77 
 
 		 421 aa  49.3  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  25.14 
 
 		 734 aa  47.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  26.44 
 
 		 810 aa  45.8  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  24.73 
 
 		 801 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  25.93 
 
 		 609 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  25.93 
 
 		 609 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.2 
 
 		 754 aa  45.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>