43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4373 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1303    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  56.34 
 
 
755 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  51.5 
 
 
454 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  50.11 
 
 
606 aa  347  5e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.5 
 
 
559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.74 
 
 
559 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  29.57 
 
 
844 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  28.4 
 
 
844 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  28.16 
 
 
847 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  28.16 
 
 
843 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  30.24 
 
 
583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  29.19 
 
 
564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.05 
 
 
668 aa  135  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  30.9 
 
 
436 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  27.75 
 
 
679 aa  118  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.39 
 
 
568 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  32.89 
 
 
792 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  26.78 
 
 
796 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  28.34 
 
 
735 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  26.34 
 
 
371 aa  101  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  26.93 
 
 
751 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  30.35 
 
 
578 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  30.88 
 
 
712 aa  93.6  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  26.37 
 
 
914 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  26.7 
 
 
671 aa  89.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  29.69 
 
 
549 aa  87.8  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  28.94 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.48 
 
 
663 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.34 
 
 
542 aa  71.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  28.81 
 
 
716 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  25.33 
 
 
880 aa  65.1  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  24.89 
 
 
605 aa  64.7  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  26.22 
 
 
605 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  26.67 
 
 
605 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  25.33 
 
 
606 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  25.33 
 
 
606 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  25.33 
 
 
609 aa  63.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  25.33 
 
 
609 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  27.31 
 
 
605 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  25.33 
 
 
609 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  31.15 
 
 
606 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  31.15 
 
 
606 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  27.96 
 
 
778 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>