64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0021 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0021  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1504    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.097053  normal  0.930139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0500  hypothetical protein  59.24 
 
 
712 aa  883    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.625158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  40.12 
 
 
844 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  39.53 
 
 
792 aa  129  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  39.53 
 
 
844 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  39.53 
 
 
847 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  39.53 
 
 
843 aa  128  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3197  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.04 
 
 
542 aa  126  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.046131  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.46 
 
 
559 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0045  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.77 
 
 
578 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.207513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.13 
 
 
668 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.13 
 
 
559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0896  ATPase  37.25 
 
 
549 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.814687  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4116  hypothetical protein  25.52 
 
 
454 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4197  ATPase  42.75 
 
 
578 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.558563  normal  0.0514875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  32.1 
 
 
679 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.9 
 
 
663 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  41.43 
 
 
583 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  27.86 
 
 
606 aa  108  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0046  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.69 
 
 
568 aa  107  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4373  hypothetical protein  28.34 
 
 
636 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4918  hypothetical protein  26.81 
 
 
755 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621409 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4260  hypothetical protein  40 
 
 
778 aa  99.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340675  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  27.56 
 
 
564 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1504  ATPase  26.99 
 
 
716 aa  96.3  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.369638  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3002  hypothetical protein  27.94 
 
 
436 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2403  site-specific DNA-methyltransferase, cytosine-specific  29.46 
 
 
671 aa  92.8  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0004  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  39.2 
 
 
914 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2266  hypothetical protein  34 
 
 
605 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2317  hypothetical protein  25.19 
 
 
606 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2393  hypothetical protein  25.19 
 
 
606 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2103  ATPase  33.33 
 
 
605 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  35.2 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2063  hypothetical protein  33.33 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1673  ATPase  34.23 
 
 
605 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3059  hypothetical protein  33.33 
 
 
605 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  40.74 
 
 
796 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2309  hypothetical protein  32.65 
 
 
606 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2283  hypothetical protein  32.65 
 
 
606 aa  82  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.380354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2067  hypothetical protein  32.65 
 
 
609 aa  82  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2129  hypothetical protein  32.65 
 
 
609 aa  82  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  40.38 
 
 
751 aa  74.7  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4192  chromosome segregation ATPase-like protein  33.54 
 
 
880 aa  74.7  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.440043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.13 
 
 
729 aa  58.9  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.51 
 
 
502 aa  55.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  28.68 
 
 
853 aa  54.7  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0694  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.21 
 
 
333 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4502  ATPase  28.83 
 
 
734 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4085  hypothetical protein  25.29 
 
 
377 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.232051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.93 
 
 
568 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.32 
 
 
410 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  32.28 
 
 
810 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  23.17 
 
 
698 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  28.26 
 
 
743 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  31.71 
 
 
655 aa  47.8  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1367  ketol-acid reductoisomerase  27.1 
 
 
340 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.845865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0660  ketol-acid reductoisomerase  30.57 
 
 
340 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.17551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0735  ketol-acid reductoisomerase  30.57 
 
 
340 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  30 
 
 
899 aa  45.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.43 
 
 
683 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  32.89 
 
 
4979 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  26.49 
 
 
781 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0882  hypothetical protein  25.93 
 
 
378 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.54 
 
 
743 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>