31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2528 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  872    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  842    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  842    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  27.1 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  27.27 
 
 		 583 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  27.33 
 
 		 844 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  27.33 
 
 		 847 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  27.33 
 
 		 843 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  26.67 
 
 		 844 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  27.11 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.62 
 
 		 559 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  26.17 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  26.64 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.08 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  22.63 
 
 		 197 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  25.29 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  23.16 
 
 		 197 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  24.06 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5841  hypothetical protein  27.21 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0796371  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4114  hypothetical protein  27.54 
 
 		 186 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  44.19 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.47 
 
 		 679 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  21.67 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  25.67 
 
 		 576 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  23.2 
 
 		 278 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  22.4 
 
 		 278 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  23.2 
 
 		 335 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  32.58 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  27.03 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  24 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0685  hypothetical protein  22.62 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.00000000242198  unclonable  0.0000000000000118124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>