18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3223 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1030    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  32.4 
 
 		 277 aa  90.1  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  38.3 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  34.31 
 
 		 595 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  34.07 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  32.35 
 
 		 576 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  34.33 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  29.5 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  33.08 
 
 		 278 aa  67  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  27.66 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  36.63 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127226 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C04  hypothetical protein  31.25 
 
 		 345 aa  56.6  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  34.52 
 
 		 103 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  27.03 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  27.03 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  27.03 
 
 		 431 aa  45.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>