14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1176 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.127226 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  35.96 
 
 
335 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  35.96 
 
 
278 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  35.56 
 
 
278 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  34.81 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  36.26 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  30.31 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  28.3 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  28.14 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  26.92 
 
 
595 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  30.7 
 
 
576 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  36.63 
 
 
498 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  29.7 
 
 
393 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  34.94 
 
 
103 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>