17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0002 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  40.58 
 
 		 380 aa  196  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  39.49 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  38.43 
 
 		 395 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  39.43 
 
 		 335 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  39.43 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  38.93 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  38.13 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  50 
 
 		 576 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  41.61 
 
 		 393 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  38.17 
 
 		 595 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  30.31 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  32.4 
 
 		 498 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  34.81 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  38.38 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2928  putative hexulose 6 phosphate synthase  37.65 
 
 		 400 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000179254 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C04  hypothetical protein  37.18 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>