14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0468 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  46.67 
 
 		 277 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  46.67 
 
 		 278 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  44.44 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  44.44 
 
 		 335 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  44.44 
 
 		 278 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  41 
 
 		 576 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  35.35 
 
 		 395 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  38.38 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  34.34 
 
 		 380 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  39.44 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  34.52 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  39.39 
 
 		 595 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  34.94 
 
 		 302 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>