19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1919 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1170    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  47.41 
 
 		 277 aa  130  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  41.57 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  41.57 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  47.41 
 
 		 278 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  34.48 
 
 		 395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  33.99 
 
 		 380 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  42.47 
 
 		 595 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  39.22 
 
 		 393 aa  107  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  41 
 
 		 103 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  32.35 
 
 		 498 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C04  hypothetical protein  32.89 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  30.7 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127226 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  25.67 
 
 		 418 aa  50.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  25.67 
 
 		 418 aa  50.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  25.67 
 
 		 431 aa  50.8  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  29.32 
 
 		 810 aa  43.9  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>