42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1013 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  796    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  37.99 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2311  hypothetical protein  43.14 
 
 		 595 aa  109  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000201823  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1919  hypothetical protein  36.88 
 
 		 576 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  unclonable  0.0000000000840766  unclonable  7.47349e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  32.26 
 
 		 583 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  28 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  28 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  28 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5841  hypothetical protein  30.93 
 
 		 197 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0796371  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  30.96 
 
 		 197 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  29.92 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  30.96 
 
 		 201 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  29.23 
 
 		 197 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  33.76 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  35.71 
 
 		 278 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.69 
 
 		 559 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  31.35 
 
 		 844 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  29.44 
 
 		 205 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3223  hypothetical protein  38.3 
 
 		 498 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  33.1 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  34.04 
 
 		 278 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  29.35 
 
 		 792 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  28.8 
 
 		 847 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  28.8 
 
 		 843 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  29.35 
 
 		 844 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.02 
 
 		 559 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  34.04 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C04  hypothetical protein  46.81 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  27.69 
 
 		 606 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4114  hypothetical protein  41.12 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  27.45 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  28.21 
 
 		 679 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0468  hypothetical protein  39.44 
 
 		 103 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.745097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2928  putative hexulose 6 phosphate synthase  29.61 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000179254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1176  hypothetical protein  29.7 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.127226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0685  hypothetical protein  22.74 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.00000000242198  unclonable  0.0000000000000118124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0516  hypothetical protein  21.98 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000163544  normal  1 
 
 
 
NC_009051  Memar_1474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1625 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109086  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2921  hypothetical protein  33.04 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24906  predicted protein  31.25 
 
 		 484 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>