20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0685 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0685  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  764    Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.00000000242198  unclonable  0.0000000000000118124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0516  hypothetical protein  62.88 
 
 
361 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000163544  normal 
 
 
 
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  36.61 
 
 
367 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3550  hypothetical protein  33.86 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  27.66 
 
 
583 aa  59.7  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  31.54 
 
 
197 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  31.91 
 
 
201 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  31.33 
 
 
201 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  26.01 
 
 
843 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  26.01 
 
 
847 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  25.68 
 
 
844 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  30.92 
 
 
197 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  27.03 
 
 
844 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  25.64 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.95 
 
 
559 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  25.68 
 
 
792 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  22.86 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  22.86 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  22.86 
 
 
431 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  27.87 
 
 
205 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>