24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1872 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1872  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.155609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5841  hypothetical protein  82.65 
 
 		 197 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0796371  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3215  hypothetical protein  77.04 
 
 		 197 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2989  hypothetical protein  77.04 
 
 		 197 aa  277  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3173  hypothetical protein  76.02 
 
 		 201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2758  hypothetical protein  74.88 
 
 		 205 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13362 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1013  hypothetical protein  30.77 
 
 		 393 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  26.63 
 
 		 583 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.28 
 
 		 559 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  28.57 
 
 		 843 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  28.57 
 
 		 847 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  28.02 
 
 		 844 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  28.02 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.77 
 
 		 559 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  31.09 
 
 		 844 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4114  hypothetical protein  32.89 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1116  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  33.09 
 
 		 679 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0840  hypothetical protein  41.54 
 
 		 606 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0025  hypothetical protein  44.19 
 
 		 418 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000509485  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0025  hypothetical protein  44.19 
 
 		 418 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000254674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2528  hypothetical protein  44.19 
 
 		 431 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000441271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6283  hypothetical protein  33.54 
 
 		 367 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0685  hypothetical protein  31.91 
 
 		 374 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.00000000242198  unclonable  0.0000000000000118124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0516  hypothetical protein  31.76 
 
 		 361 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000163544  normal  1 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>