More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0095 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  55.98 
 
 
633 aa  696  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.36 
 
 
635 aa  702  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.23168e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
599 aa  1217  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.74 
 
 
616 aa  659  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.87 
 
 
652 aa  656  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.01 
 
 
673 aa  635  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  7.47191e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.73 
 
 
630 aa  729  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.19838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  54.7 
 
 
654 aa  642  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.67 
 
 
621 aa  658  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.90574e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.57 
 
 
601 aa  645  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  54.2 
 
 
627 aa  660  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 
612 aa  659  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.63 
 
 
632 aa  697  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.77 
 
 
639 aa  758  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  66.78 
 
 
645 aa  801  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.68 
 
 
636 aa  644  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.33 
 
 
608 aa  763  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56 
 
 
602 aa  707  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.25 
 
 
637 aa  662  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.65 
 
 
672 aa  638  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.34 
 
 
619 aa  636  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.51 
 
 
656 aa  642  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  55.98 
 
 
633 aa  696  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.57 
 
 
639 aa  704  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.3 
 
 
614 aa  641  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.67 
 
 
612 aa  662  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.57 
 
 
633 aa  688  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.36 
 
 
611 aa  769  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.70708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  60.97 
 
 
693 aa  738  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.33 
 
 
620 aa  773  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.97 
 
 
697 aa  643  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.97 
 
 
697 aa  643  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.69 
 
 
610 aa  647  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
676 aa  645  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.2 
 
 
657 aa  765  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.85756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  55.98 
 
 
633 aa  696  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  55.91 
 
 
633 aa  689  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.68 
 
 
671 aa  643  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64 
 
 
615 aa  805  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 
617 aa  642  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.9937e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  55.98 
 
 
633 aa  694  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.37 
 
 
610 aa  645  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.68 
 
 
616 aa  676  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.53226e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  51.68 
 
 
614 aa  662  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  53.16 
 
 
638 aa  639  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  56.15 
 
 
633 aa  696  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.59 
 
 
653 aa  645  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  61.99 
 
 
656 aa  642  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.47 
 
 
630 aa  684  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  51.57 
 
 
700 aa  644  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.24 
 
 
643 aa  666  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  55.98 
 
 
633 aa  696  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  52.4 
 
 
682 aa  635  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  55.98 
 
 
633 aa  696  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.68 
 
 
608 aa  668  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.86964e-12  hitchhiker  9.19555e-11 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.68 
 
 
665 aa  650  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  9.7295e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  55.98 
 
 
633 aa  696  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.73 
 
 
601 aa  645  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.33 
 
 
637 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.32 
 
 
599 aa  633  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  8.44037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  52.67 
 
 
637 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.27 
 
 
646 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.97526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.81 
 
 
672 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.46 
 
 
638 aa  628  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.46 
 
 
640 aa  626  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  51.17 
 
 
635 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.45 
 
 
679 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.09 
 
 
634 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.17 
 
 
635 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.17 
 
 
635 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  51.4 
 
 
613 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  56.27 
 
 
753 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  49.92 
 
 
617 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.94 
 
 
682 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.45 
 
 
607 aa  619  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.4 
 
 
617 aa  618  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  50.08 
 
 
617 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  50.75 
 
 
639 aa  618  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  50.75 
 
 
639 aa  618  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.58 
 
 
687 aa  618  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  49.92 
 
 
617 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  51.24 
 
 
689 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.67 
 
 
635 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.62887e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.58 
 
 
616 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  52.77 
 
 
602 aa  614  1e-174  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
612 aa  613  1e-174  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.65 
 
 
656 aa  612  1e-174  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.02 
 
 
616 aa  614  1e-174  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.49 
 
 
647 aa  613  1e-174  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.02 
 
 
616 aa  614  1e-174  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.29 
 
 
753 aa  614  1e-174  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.32 
 
 
759 aa  613  1e-174  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.25 
 
 
652 aa  609  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  49 
 
 
647 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.70783e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.5 
 
 
634 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.03 
 
 
604 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  6.86263e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  48.25 
 
 
641 aa  611  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.58 
 
 
640 aa  611  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  51.64 
 
 
613 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  51.16 
 
 
613 aa  610  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>