More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0008 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 383 aa  782    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  50.92 
 
 		 388 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  47.21 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  49.31 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  49.31 
 
 		 362 aa  362  8e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  48.2 
 
 		 362 aa  358  7e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  47.27 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  47.27 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  46.99 
 
 		 384 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  50 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  46.24 
 
 		 382 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  46.39 
 
 		 385 aa  342  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  45.6 
 
 		 406 aa  342  9e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  47.22 
 
 		 386 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.86 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  44.97 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  44.82 
 
 		 406 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  45.82 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  44.1 
 
 		 387 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  42.74 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  42.74 
 
 		 384 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  43.95 
 
 		 385 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  44.74 
 
 		 383 aa  329  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  43.93 
 
 		 406 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  43.18 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  45.08 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  43.57 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  43.35 
 
 		 385 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  43.46 
 
 		 381 aa  325  6e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  46.52 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  42.64 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  44.3 
 
 		 397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  44.09 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  42.35 
 
 		 413 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  42.31 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  42.89 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  41.32 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  42.2 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.85 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  43.5 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  45.43 
 
 		 391 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  43.92 
 
 		 398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  42.38 
 
 		 394 aa  312  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  44.41 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  41.51 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  44.2 
 
 		 402 aa  309  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  44.41 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  41.34 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  42.3 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  42.2 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  43.4 
 
 		 401 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  40.94 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  41.09 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  43.08 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  39.79 
 
 		 384 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  42.12 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  41.47 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  41.32 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  40.43 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  39.52 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  42.59 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  42.32 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  41.25 
 
 		 396 aa  299  7e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  40.48 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  39.79 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  39.79 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  40.31 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  39.68 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  39.06 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  40.8 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  38.7 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  38.58 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  38.82 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  37.47 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  39.95 
 
 		 395 aa  275  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  38.2 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  37.47 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  39.01 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  39.83 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  36.55 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  38.73 
 
 		 396 aa  269  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  37.73 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.66 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.1 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  36.24 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  37.21 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  36.6 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  36.95 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  35.62 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  35.36 
 
 		 379 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  39.69 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.6 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  40.22 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  40.05 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  35.88 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  36.32 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  39.62 
 
 		 397 aa  255  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.13 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  36.17 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>