More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4700 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4700  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0672419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  75.38 
 
 		 150 aa  215  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1437  3-dehydroquinate dehydratase  63.85 
 
 		 146 aa  175  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0623689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  61.54 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  60.8 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  56.69 
 
 		 146 aa  153  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  60.16 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  57.69 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  59.84 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  57.69 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  57.94 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  56.15 
 
 		 176 aa  150  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  56.15 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  60.94 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  57.6 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  58.4 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.63 
 
 		 184 aa  145  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  55.04 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.31 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  56.69 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  54.96 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  56 
 
 		 150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 155 aa  143  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  56.92 
 
 		 151 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  51.91 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  55.81 
 
 		 146 aa  143  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  58.4 
 
 		 156 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  58.46 
 
 		 149 aa  141  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  56.35 
 
 		 144 aa  141  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  56.15 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  56.92 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 207 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  51.61 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  55.81 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  51.13 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  51.13 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  51.56 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 207 aa  140  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 207 aa  140  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  50.76 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 148 aa  140  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  51.15 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  56.69 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  51.88 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  56.69 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  54.33 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  51.15 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  50.76 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  50.77 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.54 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  52.76 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  52.76 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  51.59 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  51.18 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  62.7 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  52.76 
 
 		 154 aa  135  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.34 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  56.69 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  53.44 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  53.54 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  53.54 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  54.4 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  53.91 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  53.54 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.54 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  52.31 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0370  3-dehydroquinate dehydratase  55.65 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  51.54 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  51.54 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  53.54 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  53.54 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  53.17 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.54 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  60.83 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  53.54 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.46 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  52 
 
 		 148 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  52.42 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.91 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  51.97 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.56 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  51.16 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  55.12 
 
 		 151 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  52.71 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  53.12 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  50.77 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>