174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4219 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  100 
 
 		 241 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  73.57 
 
 		 241 aa  341  5.999999999999999e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  58.82 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  56.28 
 
 		 241 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  54.89 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  53.81 
 
 		 273 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  54.66 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  57.08 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  56.83 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  55.31 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  50.81 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  52.34 
 
 		 273 aa  231  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  52.34 
 
 		 273 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  52.77 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  52.34 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  52.34 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  51.91 
 
 		 273 aa  230  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  51.91 
 
 		 273 aa  230  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  52.77 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  52.77 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  51.49 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  52.28 
 
 		 272 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  55.86 
 
 		 244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  52.3 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  51.93 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  51.93 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  51.93 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  52.47 
 
 		 242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  52.28 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  49.79 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  51.53 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  47.41 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  48.79 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  45 
 
 		 234 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  45 
 
 		 234 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  48.03 
 
 		 247 aa  198  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  48.33 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  45.1 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  45.38 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  46.69 
 
 		 232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  48.05 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  48.41 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  47.64 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  47.64 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  47.64 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  47.64 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  47.64 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  47.64 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  47.64 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  47.64 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  46.89 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  48.56 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  42.08 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  48.92 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  47.95 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  47.86 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  41.67 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  44.21 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  45.75 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  46.46 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  47.33 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  43.78 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  46.69 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  45.53 
 
 		 239 aa  178  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  46.43 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  45.98 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  45.98 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  45.98 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  45.98 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  45.98 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  46.75 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  47.01 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  40.48 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  46.38 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  37.87 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  45.61 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  38.36 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  38.94 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1392  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  35.44 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000178707  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  38.24 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  41.49 
 
 		 274 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  32.58 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  34 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  33.96 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2341  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  31.56 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.395885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  36.8 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  37.92 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  32.61 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  37.23 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  37.55 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  35.04 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  35.34 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  33.2 
 
 		 340 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  35.92 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  36.8 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  34.4 
 
 		 338 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3904  major intrinsic protein  33.06 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.333674  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00830  MIP aquaporin (Eurofung)  33.47 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.683502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4167  glycerol uptake facilitator protein  33.06 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  36.33 
 
 		 267 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>