188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0217 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  100 
 
 		 259 aa  502  1e-141  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  49.8 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  46.46 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  48.98 
 
 		 233 aa  192  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  43.53 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  48.09 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  45.28 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  44.14 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  48.18 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  46.15 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  45.63 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  46.56 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  42.34 
 
 		 249 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  45.93 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  47.26 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  45.2 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  46.69 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  42.98 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  42.98 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  43.14 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  43.25 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  42.97 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  44.77 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  43.88 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  45.68 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  46.64 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  43.95 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  41.96 
 
 		 243 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  40.71 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  44.4 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  44.4 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  45.57 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  44 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  44 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  41.74 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  41.74 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  41.74 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  41.74 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  41.74 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  41.74 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  41.74 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  41.57 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  44 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  44 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  44.08 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  42.67 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  43.03 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  42.67 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  44 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  44 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  41.95 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  42.44 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  41.81 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  42.19 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  41.81 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  42.57 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  41.81 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  44.27 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  41.81 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  42 
 
 		 275 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  44 
 
 		 273 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  41.77 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  41.6 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  40.62 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  40.48 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  39.53 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  42.08 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  42.45 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  42.45 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  41.83 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  40.65 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  38.84 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  41.13 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  38.78 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  41.8 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  40.08 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  38.19 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  39.74 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  36.79 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  39.58 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  35.46 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1392  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  33.73 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000178707  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  35.04 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2341  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  32.4 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.395885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  31.45 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  33.92 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  34.23 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  33.88 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03312  hypothetical protein  35.55 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  34.51 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0384  glycerol uptake facilitator protein  37.02 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.418128  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  35.8 
 
 		 338 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1105  MIP family channel protein  32.85 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002676  glycerol uptake facilitator protein  34.77 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45700  glycerol uptake facilitator protein  33.33 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1562  glycerol uptake facilitator protein  32.27 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  33.83 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  31.92 
 
 		 340 aa  89  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0409  glycerol uptake facilitator protein  37.16 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1076  MIP family channel protein  32.5 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>