226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  100 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  71.64 
 
 
142 aa  212  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  66.17 
 
 
138 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  69.92 
 
 
137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  56.72 
 
 
175 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 
142 aa  173  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  55.64 
 
 
143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  58.33 
 
 
145 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 
149 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  59.54 
 
 
148 aa  167  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  55.56 
 
 
149 aa  166  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  55.64 
 
 
203 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 
153 aa  164  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  56.82 
 
 
153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  57.46 
 
 
145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  57.58 
 
 
153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  56.35 
 
 
181 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  52.63 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  56.35 
 
 
181 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  56.35 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  56.25 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  56.35 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  56.35 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  56.35 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  54.2 
 
 
147 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  56.06 
 
 
145 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  54.2 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  56.06 
 
 
145 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  53.73 
 
 
144 aa  160  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
150 aa  160  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  57.04 
 
 
150 aa  160  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 
147 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 
163 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  51.13 
 
 
153 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  55.3 
 
 
147 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 
142 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
145 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  55.12 
 
 
147 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
162 aa  157  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
162 aa  155  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 
160 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 
188 aa  154  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  56.1 
 
 
150 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 
156 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  58.41 
 
 
125 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 
143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  52.85 
 
 
143 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  52.85 
 
 
143 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  51.15 
 
 
150 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  47.76 
 
 
143 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  52.27 
 
 
137 aa  140  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  46.56 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 
147 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 
147 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  45.8 
 
 
147 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 
146 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  37.59 
 
 
169 aa  101  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  34.09 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  26.67 
 
 
161 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  27.42 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  29.6 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  30.16 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  27.41 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
138 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  29.6 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>