More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  67.89 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  57.94 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  56.06 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  58.7 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  53.93 
 
 		 264 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  58.7 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  58.7 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  56.85 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  57.2 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 		 1106 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.15 
 
 		 634 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  38.13 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  37.24 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 1032 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.81 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  35.08 
 
 		 870 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  34.41 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.06 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 885 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  30.16 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.03 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 810 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  32.19 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  38.71 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.49 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.7 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.1 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12966  methyltransferase  32.18 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.43 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  29.21 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.06 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 1162 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.86 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.86 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  37.19 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.95 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.03 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.22 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.89 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  32.45 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  30 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.16 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.78 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0557  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.93 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.82 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.87 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3693  hypothetical protein  29.09 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.62 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>