More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03590 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 116 aa  225  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  56.64 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  56.64 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  49.57 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  57.02 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  52.68 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  49.56 
 
 		 117 aa  98.6  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  56.98 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3464  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  31.97 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  29.57 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  46.34 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1390  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000697536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  33.04 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  29.51 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4641  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  28.69 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  28.69 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  32.2 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  25.86 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  48.61 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  31.93 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  38.26 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  31.97 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  31.93 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  41.23 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  33.88 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  31.15 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  35.09 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  30.43 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6454  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 470 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1433  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 470 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139667  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6395  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 470 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  42.16 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0938  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>