More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1305 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  80.62 
 
 		 158 aa  230  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  66.89 
 
 		 168 aa  190  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  70.54 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  72.55 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  74.74 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  69.03 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  68.63 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  71.88 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  69.31 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12923  30S ribosomal protein S16  60.87 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.826155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  62.07 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  62.07 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  66.36 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3594  30S ribosomal protein S16  58.14 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  62.07 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1617  ribosomal protein S16  58.27 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0355567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  70 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1148  30S ribosomal protein S16  61.9 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0271255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  62.07 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  73.33 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 170 aa  140  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09750  SSU ribosomal protein S16P  71.11 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  66.32 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  57.46 
 
 		 157 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  68.89 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  52.45 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  70 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  68.89 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  68.89 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  60.33 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  69.41 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  49.66 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3260  SSU ribosomal protein S16P  57.89 
 
 		 465 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  54.39 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  53.51 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  57.47 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  53.01 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  50 
 
 		 93 aa  94.4  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 88 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  51.19 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  38.73 
 
 		 186 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 88 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  52 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  52 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  43.7 
 
 		 191 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 85 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 136 aa  84  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  45 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19103  predicted protein  49.38 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  48.19 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>