48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0443 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  85.8 
 
 		 338 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  40.99 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  39.83 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3390  hypothetical protein  40.29 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  39.47 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  37.13 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  31.51 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  49.21 
 
 		 300 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  27.51 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  27.37 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  23.62 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  27.64 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  26.59 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  37.14 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  40.78 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.21 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  36.07 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.15 
 
 		 547 aa  72.8  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  33.61 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  37.76 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  39.78 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  32.79 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  42.22 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  30.4 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  26.74 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  35.29 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  28.85 
 
 		 434 aa  50.1  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.58 
 
 		 364 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  32.38 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  30.56 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  30.56 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  32.38 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  32.38 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  45.83 
 
 		 1050 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  23.12 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.48 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1369  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  27.68 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  26.45 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1194  hypothetical protein  31.11 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  26.81 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5355  hypothetical protein  34.18 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  42.7  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5444  hypothetical protein  34.18 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  34.18 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.765847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>