More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0202 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
153 aa  298  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  89.54 
 
 
165 aa  261  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  62.09 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  70.97 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  71.77 
 
 
168 aa  179  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.09 
 
 
159 aa  177  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5594  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  71.2 
 
 
166 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36880  tRNA-adenosine deaminase  72 
 
 
147 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.699352  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  71.43 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  70.16 
 
 
154 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1214  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  68.8 
 
 
149 aa  167  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.84513  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  74.19 
 
 
152 aa  167  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  64.62 
 
 
167 aa  167  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0277  tRNA-adenosine deaminase  66.93 
 
 
143 aa  165  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0171  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  75.2 
 
 
160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.681165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.96 
 
 
168 aa  164  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13784  cytidine/deoxycytidylate deaminase  75.44 
 
 
152 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.507969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  64.8 
 
 
176 aa  163  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.24 
 
 
158 aa  159  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5341  tRNA-adenosine deaminase  73.6 
 
 
150 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359927  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  64.84 
 
 
176 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5048  tRNA-adenosine deaminase  73.6 
 
 
150 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4960  tRNA-adenosine deaminase  73.6 
 
 
150 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.09 
 
 
157 aa  158  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  65.6 
 
 
154 aa  157  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2714  tRNA-adenosine deaminase  53.95 
 
 
196 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227671  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0208  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  69.91 
 
 
190 aa  155  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.672477  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.49 
 
 
144 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0357  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.26 
 
 
154 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  51.32 
 
 
149 aa  154  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6533  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.64 
 
 
185 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03330  tRNA-adenosine deaminase  62.31 
 
 
168 aa  151  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0027  tRNA-adenosine deaminase  63.7 
 
 
150 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04500  tRNA-adenosine deaminase  66.37 
 
 
147 aa  148  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0310  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4829  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  73.83 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.6 
 
 
166 aa  144  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  55.91 
 
 
171 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0469  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.57 
 
 
144 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176891  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  45.6 
 
 
160 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.03 
 
 
176 aa  140  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  53.54 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.42 
 
 
166 aa  138  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.73 
 
 
154 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.59 
 
 
475 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.4 
 
 
155 aa  137  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.97 
 
 
166 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03340  tRNA-adenosine deaminase  63.87 
 
 
162 aa  136  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.38 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  50 
 
 
165 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  47.2 
 
 
153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.69 
 
 
148 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  53.97 
 
 
170 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  51.59 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.6 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.37 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  47.24 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.4 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3779  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.26 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  57.26 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0325  tRNA-adenosine deaminase  47.2 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00296157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  46.4 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  47.2 
 
 
168 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.22 
 
 
166 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0738  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.97 
 
 
153 aa  131  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000176793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.39 
 
 
152 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.45 
 
 
183 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.81 
 
 
157 aa  130  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.2 
 
 
361 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.2 
 
 
361 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1819  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein, putative  48 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000174201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.07 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.97 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.61 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.4 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  48.44 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.38 
 
 
174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.56 
 
 
156 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.2 
 
 
150 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  56.1 
 
 
151 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.8 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0400  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.83 
 
 
168 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000750433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.12 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6871  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.97 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.385283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.8 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.18 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  53.23 
 
 
196 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26030  tRNA-adenosine deaminase  56.69 
 
 
159 aa  127  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.44 
 
 
152 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0760  hypothetical protein  47.62 
 
 
155 aa  127  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.2 
 
 
484 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.6 
 
 
148 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.42 
 
 
187 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  50.79 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>