96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1004 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  555  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  53.31 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  52.54 
 
 		 278 aa  260  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  46.84 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  50.56 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  48.33 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  46.44 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  45.59 
 
 		 274 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  47.81 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  47.41 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  45.52 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  44.85 
 
 		 447 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  44.49 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  45 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  44.24 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  41.04 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  38.35 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  37.36 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  39.93 
 
 		 481 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  39.7 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  36.67 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  36.19 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  39.41 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  35.66 
 
 		 522 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  35.36 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  33.68 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  35.29 
 
 		 484 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  31.79 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  33.91 
 
 		 269 aa  135  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  33.68 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  31.5 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  32.26 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  34.24 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  31.67 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  31.32 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  28.26 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  31.32 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  32.51 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  32.38 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  32.75 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  33.45 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  32.28 
 
 		 284 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  32.17 
 
 		 287 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  30.31 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  31.45 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  31.14 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  32.38 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  29.68 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  30.43 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  30.5 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  29.39 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  30.55 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  29.72 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  30.82 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  28.72 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  31.93 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  29.35 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  28.62 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  30.63 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  29.57 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  30.66 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  30.9 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  29.55 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  30.32 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  27.96 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  29.72 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  28.37 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  32.52 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  36.14 
 
 		 346 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  29.39 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  29.89 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  30.53 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  29.97 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  29.39 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  30.66 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  27.76 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  26.88 
 
 		 438 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  34.52 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0469  hypothetical protein  27.95 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49668  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  26.52 
 
 		 438 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  30.88 
 
 		 356 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  26.5 
 
 		 438 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1254  protein of unknown function DUF52  34.69 
 
 		 265 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.286029  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  27.73 
 
 		 345 aa  85.5  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1355  protein of unknown function DUF52  34.69 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.235879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  32.66 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  28.37 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0526  dioxygenase-like protein  30.81 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.579832  normal  0.413841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  25.96 
 
 		 405 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  23.69 
 
 		 405 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  29.31 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  25.62 
 
 		 414 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  28.1 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>