84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3629 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  808    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  83.21 
 
 		 405 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  44.69 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  31.07 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  43.33 
 
 		 299 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3387  protein of unknown function DUF52  43.49 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  27.18 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  27 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  29.77 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  26.04 
 
 		 271 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  24.09 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  26.09 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  26.43 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  28.93 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  23.76 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  25.82 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  28.26 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  32.67 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  29.71 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  27.37 
 
 		 271 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  25.71 
 
 		 267 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  26.5 
 
 		 267 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  25.51 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  27.74 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  29.92 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  29.02 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  26.54 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  29.25 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  27.54 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  25.7 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  25.21 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  25.8 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  24.35 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  26.01 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  25.21 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  28.33 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  26.48 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  27.09 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  26.83 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  27.44 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  25.95 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  23.86 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  29.27 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  23.25 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  24.18 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  28.27 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  24.81 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  22.95 
 
 		 262 aa  57  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  27.64 
 
 		 274 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  24.04 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  27 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  23.25 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  25.74 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  26.17 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  25.61 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  19.4 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  24 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  28 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  26.21 
 
 		 285 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  25.95 
 
 		 282 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  27.65 
 
 		 283 aa  53.1  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  21.61 
 
 		 356 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  26.24 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  29.53 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  22.61 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  25.63 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  22.73 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  27 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  29.41 
 
 		 268 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3224  protein of unknown function DUF52  26.03 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  25.71 
 
 		 270 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  27.19 
 
 		 264 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  26.15 
 
 		 274 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  25.08 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2594  hypothetical protein  32.14 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  22.22 
 
 		 282 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2891  hypothetical protein  29.29 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  24.29 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  26.54 
 
 		 287 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  27.63 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  23.53 
 
 		 265 aa  43.1  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>