65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0075 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  850    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  31.46 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  31.07 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  35.07 
 
 		 299 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  35.09 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3387  protein of unknown function DUF52  34.7 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  29.77 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  26.99 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  26.41 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  27.27 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  29.04 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  27.1 
 
 		 262 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  26.59 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  26.6 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  29.48 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  25.68 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  28.41 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  26.87 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  26.16 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  26.48 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  27.33 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  26.43 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  29.55 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  31.27 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  28.14 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  28.9 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  28.62 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  29.23 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  25.91 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  24.82 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  24.72 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  25.83 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  23.67 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  28.48 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  24.58 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  25.27 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  25.09 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  27.41 
 
 		 269 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  23.57 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  28.21 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  24.67 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  26.42 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  27.86 
 
 		 265 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  26.87 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  29.95 
 
 		 282 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  25.63 
 
 		 267 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  23.26 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  29.94 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  25.57 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  29.88 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  26.12 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  26.81 
 
 		 267 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  29.19 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  26.76 
 
 		 267 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  26.91 
 
 		 267 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  28.4 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  26.96 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  28.4 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  27.6 
 
 		 274 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  26.88 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1868  protein of unknown function DUF52  29.24 
 
 		 298 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  25.62 
 
 		 270 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  28.3 
 
 		 464 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>