More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7238 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  47.01 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  44.54 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  44.25 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  39.67 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  45.69 
 
 		 119 aa  88.6  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  43.36 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  50.43 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  46.08 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  37.82 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  37.29 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  49.28 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  40.35 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  43.01 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  36.67 
 
 		 253 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  35.96 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2524  transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0506467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 391 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  32.74 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 334 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  43.84 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 345 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  37.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  39.51 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  38.27 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  34.17 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  42.47 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  49.23 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 390 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 390 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  44.64 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 342 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>