More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5126 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  545  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  65.03 
 
 		 334 aa  338  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.33 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  45 
 
 		 379 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.55 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  41.58 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  32.26 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.19 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  32.33 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  34.67 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  33.45 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  31.34 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  33.45 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  41 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.13 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  36.13 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  35.94 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  34.63 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  31.58 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  34.06 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  32.64 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  32.12 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  31.99 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  31.14 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  29.82 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  33.57 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  32.26 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  27.91 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.5 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  30.74 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  34.21 
 
 		 307 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  33.67 
 
 		 308 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  33.67 
 
 		 308 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  33.11 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.69 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  31.01 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  33.55 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  32.99 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.51 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  30.48 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  30.93 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  34.02 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  30.42 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  32.99 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.62 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  32.99 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  31.56 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  36.28 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  33.1 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  32.99 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  32.99 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  32.99 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  31.7 
 
 		 308 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  30.22 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  29.29 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  32.65 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  32.41 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  34.43 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  32.41 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  27.61 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  32.75 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  31.29 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  29.69 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  32.18 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  32.18 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  29.54 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  32.76 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  33.58 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.86 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  30.88 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  32.39 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0490  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.19 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.95 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  30.38 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  31.01 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  27.66 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  31.18 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  28.72 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  24.74 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.39 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  30.03 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  30.3 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  30.3 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>