More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3703 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  90.45 
 
 		 473 aa  693    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  100 
 
 		 477 aa  909    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  67.45 
 
 		 477 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  64.6 
 
 		 478 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.7 
 
 		 487 aa  319  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 		 527 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.41 
 
 		 490 aa  285  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.96 
 
 		 763 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.14 
 
 		 498 aa  276  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.07 
 
 		 479 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.25 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.53 
 
 		 482 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.53 
 
 		 482 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 		 507 aa  266  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.7 
 
 		 534 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.01 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.71 
 
 		 519 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.35 
 
 		 479 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.35 
 
 		 479 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.71 
 
 		 479 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.5 
 
 		 493 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.39 
 
 		 482 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.78 
 
 		 479 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.99 
 
 		 497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 788 aa  254  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.77 
 
 		 487 aa  253  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  39.46 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 		 513 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.54 
 
 		 506 aa  249  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  36.7 
 
 		 497 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  41.63 
 
 		 492 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 		 519 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.57 
 
 		 502 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.26 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  44.26 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.26 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 		 1112 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.02 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.02 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.02 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.02 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.26 
 
 		 508 aa  243  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.96 
 
 		 489 aa  242  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.02 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.47 
 
 		 496 aa  240  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.5 
 
 		 548 aa  239  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  43.1 
 
 		 480 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.89 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  42.89 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 494 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.29 
 
 		 474 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.2 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.25 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5374  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 481 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.71 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.46 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.46 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.5 
 
 		 487 aa  230  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 470 aa  226  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  37.01 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 468 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 		 504 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 481 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  39.52 
 
 		 505 aa  217  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 518 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 522 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 487 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.61 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 501 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.97 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  38.58 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 483 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  36.79 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 485 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 482 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 472 aa  206  9e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  35.2 
 
 		 489 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  39.04 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 483 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2510  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.563077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  34.96 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 486 aa  199  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>